不是所有的公司都用同一种方式完成设定和分解目标的过程。研究一下不同的组织，就会发现各组织间存在着许多明显的不同。通常来说，有以下三种方法：
（1）先宣布公司的总目标，然后按组织向下传递，供各级管理人员在制定目标时使用，即从上到下。
（2）先从基层开拓，多方面逐步建立起公司的总目标。即从下到上。
（3）一边召开会议和广泛地交换意见，一边制定各种目标。会议由各级管理人员参加。
上述的每一种方法，在单独作为一种方法使用时，都存在严重的缺陷。
第一种方法，或称为从上到下的方法，最终常常会形成这样的一种状态：下层管理人员认为既然目标早已确定，所以在向上反馈时，会多讲一些上级爱听的话。这种方法会阻碍员工参与管理和广泛交换意见，对于有效推行目标管理是十分不利的。
从下到上法的缺点是不同层级的管理者强调不同的重点，而且在组织结构的阶梯上，越是处在下层的管理人员，越注重眼前的利益，随着管理阶梯逐渐上升，未来的利益才会被重视。因此，从低层开始制定目标，在很大程度上，目标会受限于现状，甚至会保持现状永久不变也是常有的事。另一个缺点则是下级管理人员对于要求他们做的事大都缺少上级的指导。
而企图一次建立所有目标的方法是三种方法中效果最差的，虽然这种方法看上去实现了最大范围的参与管理，但是这种参与的结果只能是一篇混乱。除非是在特别小的组织里和只有寥寥几个管理人员时，才可能奏效。
